Oftmals beginnt die Myoreflex-Sitzung mit einer Palpation (Abtasten) des Atlas d.h. ersten Halswirbels. Hierbei können Fehlstellungen erkannt und bereits in dieser frühen Phase beeinflußt werden. Sehr viele Muskeln des Halses und des Schultergürtels setzen am Atlas an. Die Atlaspalpation bewirkt unter anderem eine Entspannung aller Körpermuskeln (eine Herabsetzung des Muskeltonus). Diese fällt dem Patienten oft durch eine spontane Verbesserung bei der Kopfdrehung auf: ohne Anstrengung oder Schmerzen kann der Kopf weiter nach links und rechts gedreht werden.

Ein weiterer möglicher Effekt der Atlasbehandlung: die Wirbelarterie (Arteria vertebralis) verläuft durch den Atlas hindurch und beschreibt dort zwei scharfe Wendungen von teilweise mehr als 90°. Eine positive Beinflussung der Atlasstellung kann den Blutfluß und somit die Blutversorgung wichtiger Hirnbereiche verbessern.